摘要:药物-靶点结合亲和力(drug-target binding affinity, DTA)的精确预测对于药物研发和虚拟筛选具有关键意义. 然而, 现有深度学习方法仍普遍存在对蛋白质三维结构利用不足、相似序列信息挖掘有限以及模型泛化能力不足等问题. 为此, 本研究提出了一种基于语言模型与多尺度特征融合的DTA预测模型FusionLM-DTA. 该模型基于AlphaFold预测的蛋白质三维结构进行特征初始化, 从而增强其对蛋白质空间构象的表征能力. 同时, 利用预训练分子序列模型ESM-2和ChemBERTa提取蛋白质和药物的高维语义特征, 并进一步通过外部注意力增强的Bi-Mamba模块捕获双向序列依赖关系及相似序列间的潜在关联. 此外, 设计的门控多尺度线性注意力机制进一步提升了序列特征的建模能力. 实验结果显示, FusionLM-DTA在Davis与KIBA数据集上的多个评价指标均显著优于基线方法, 验证了该模型的有效性与优越性能.